对于慢性咽炎和急性咽炎的区分，可以从临床症状以及自然病程方面进行叙述。
急性咽炎容易在短时间内突然发作，患者会以嗓子疼痛、咽喉异物感、咳嗽以及发热等临床症状为主，一般多继发于感冒。慢性咽炎发病期间，患者容易长期反复出现嗓子干痒、咽喉异物感以及恶心、干呕等临床症状。当患者免疫力下降时，慢性咽炎容易急性发作，其症状类似于急性咽炎。
就病程而言，急性咽炎经过治疗一般在7天病情可以好转。而慢性咽炎病程较长，患者症状容易长时间存在，病程可以达到数月或数年之久。