导致脚趾甲缝疼的原因比较多，主要概括如下：
1.与外伤有关。比如脚趾甲受到外力的撞击，容易造成局部软组织出现损伤，或者导致指甲、甲床分离，往往会引起明显疼痛。
2.可见于穿不合适自己脚的鞋子，导致脚趾长时间受到挤压、磨损，就容易引发局部疼痛。一般在更换舒适鞋子之后，一段时间即可缓解。
3.不排除是甲沟炎造成。比如修剪脚趾甲时导致局部损伤，或者是脚趾甲剪得太短、脚趾甲刺破皮肤造成感染等，不仅会导致局部疼痛，往往还会出现红肿或化脓。