上颌前突手术后遗症有：如果力学施加不妥当可能会引起磨牙伸长，力量过大会造成颌骨以及牙齿的创伤。术后口腔卫生环境差，不引起足够重视会患有龋齿、牙龈炎以及牙周炎等。
因改变面部颌骨的骨性结构，从而也会改变自身长期稳定的口颌系统，会出现上颌进一步后退、口腔发生缩小以及舌体活动空间异常受限等，不佩戴正畸保持器，就会有复发的风险。
需严格遵守医生的嘱托，按照医生的要求来科学处理，上颌前突手术可能出现的一系列术后的后遗症一般会相对减轻。