颅内静脉血栓形成可能会头痛，头痛通常为主要的临床表现。
主要是因为颅内静脉血栓形成是颅内静脉结构出现闭塞或血栓，进而导致大脑缺血、缺氧、颅内压过度增高，致使大脑得不到充足的氧气供应就会出现头痛。同时还会伴有恶心以及呕吐等症状。严重者可能会造成瘫痪、视力丧失、精神状态改变，甚至是昏迷等。该病患者还容易遗留不同程度的神经系统方面的后遗症。
因此，在确诊该病后应及早进行对症治疗。目前主要是进行溶栓治疗、抗凝治疗以及病因治疗，同时需要配合进行对症支持治疗。