肺孢子菌肺炎严重。肺孢子菌肺炎是严重的肺部真菌感染，其严重性首先在于临床症状上，此类患者多伴有明显的畏寒、发热、干咳、喘闷等不适。
严重患者可以出现呼吸困难，甚至因此引起呼吸衰竭，此时患者还有一定的病死率，病情较为严重。特别是非艾滋病的感染者出现肺孢子菌肺炎时，病情进展更为迅速、患者缺氧症状更明显，病死率也较高。
此外，患有肺胞菌肺炎的患者多见于免疫低下的患者，例如肿瘤、器官移植、艾滋病等。此些疾病本身也较为严重，患者抵抗力下降，治疗效果也不佳。故当发生肺孢子菌肺炎时要早期抗感染和对症支持治疗，以改善病情严重程度和降低病死率。