垂体性侏儒症可能会遗传的，虽然不是遗传性的疾病，但是具有一定的遗传倾向，部分患者也具有一定的家族史，主要由于生长激素分泌不足而引起。
另外，还可能会受到一些病变的影响，如垂体瘤、颅咽管瘤、血吸虫病、结核、脑炎、外力伤害、血管坏死等病变影响到垂体时，造成生长激素缺乏，生长发育停滞。
如果是疾病引起的，首先应当对原发疾病进行治疗，如颅咽管瘤应当及早进行手术。特发性的患者需要应用生长激素替代补充治疗，如不及时进行治疗，将会导致患者身材矮小，增加心血管疾病的发生率。