治疗畸形性吞咽困难的中药有肌炎灵胶囊、肌炎2号冲剂。畸形性吞咽困难主要是因右边锁骨下面的动脉发育畸形，或是走向异常而压迫食管，引起吞咽困难的疾病。
如果畸形性吞咽困难的症状较轻微，可通过药物和优化饮食结构治疗，症状严重者需进行手术治疗，以免造成呼吸困难。
在饮食上平时注意多饮用含有丰富蛋白质的牛奶，以及多吃一些软质的、滋养型的食物，主要以流质、易消化的食物为主。尽量不要吃肥肉、玉米类，粗糙、含高纤维的食物。同时还要注意少吃生冷、坚硬的食物，以免加重吞咽困难的表现。