结膜病主要是指结膜炎，结膜炎的治疗原则是针对病因治疗，局部给药为主，必要时全身用药。急性期禁忌包扎患眼。
局部滴眼液是最基本的给药途径，对于微生物性结膜炎选用敏感的抗生素或抗病毒眼药水。必要时根据病原体培养和药敏试验，选择有效的药物。急性期频繁点眼，每一到两小时一次，病情好转后，减少滴眼次数。
再眼膏涂眼，睡前使用，可持续的发挥治疗作用。结膜囊分泌物较多时，可用无刺激性的冲洗液如生理盐水或者是3%的硼酸水冲洗，每天一到两次，切除结膜囊内的分泌物。
严重的结膜炎如淋球菌性结膜炎和衣原体性结膜炎除局部用药以外，还需要全身使用抗生素治疗。