顽固性睡眠障碍需要针对引起症状的相应病因，能够有效地治疗。
如果是躯体疾病引起的顽固性睡眠障碍，如疼痛、咳嗽、尿频等症状，需要到相关科室去缓解身体症状，睡眠障碍才会痊愈。如果是由情绪问题、焦虑、抑郁引起的睡眠障碍，需要到心理科或者睡眠门诊进行焦虑、抑郁量表检查后，应用抗焦虑、抑郁药物，并需要长时间服药，能够改善失眠症状。
如果是由于环境因素、时差等导致顽固性的睡眠障碍，需要及时改善不良的生活方式。