新生儿期出现的黄疸，服用益生菌有辅助退黄的作用。因为导致新生儿出现黄疸的原因之一就是胆红素的生成增加。
新生儿出生的时候，肠道是无菌的，随着生长发育，新生儿接受外界环境，慢慢的肠道有宜的细菌在肠道定置下来，参与胆红素的代谢和食物的消化吸收，维持正常的肠道功能。如果肠道的正常菌群少，不能及时把结合胆红素分解为尿胆原、粪胆原排出体外。
肠道的葡萄糖醛酸苷酶把结合胆红素转化为非结合胆红素，生成的非结合胆红素经过肠道吸收导致黄疸加重，所以补充益生菌可以起到辅助退黄的作用。