链球菌性咽炎在治疗时，具体使用的药物，需要根据不同的治疗方式来判断。
如果是通过含漱的方式来进行治疗，可以选用生理盐水或者是复方硼砂溶液等药物。此类药物可以有效起到杀菌消炎、促进咽喉黏膜充血、肿胀的表现消退的功效。但如果是通过口服或者是静脉滴注的方式来进行治疗，则青霉素类的抗生素药物是首选药物。因为青霉素对于链球菌的杀灭效果较好，因此可有效消退链球菌性的炎症感染。
另外，针对有较为严重的咽喉疼痛表现的患者，还可以口服布洛芬等止痛药物来处理。