先天性心脏病主要多见于房间隔缺损、室间隔缺损和动脉导管未闭，通过修补手术治疗。手术后遗症多常见有胸骨愈合不良或者畸形愈合，有的可能会出现少量的无菌性心包积液。
还有一些复杂的先天性心脏病，如法洛四联症、大动脉转位、单心室，相应的手术治疗也会比较复杂，手术目的是提高存活率。由于术后心脏功能的恢复情况，可能会导致生活方式的改变，不能像其他健康的孩子进行正常的体育活动，体质偏弱。所以生长发育相对缓慢，可能会反复呼吸道感染，还会增加发生心肌炎、心肌病、心律失常、心功能不全的风险。
所以术后最少每年进行一次体检，预防术后并发症和后遗症发生的可能。