治疗急性胰腺炎主要是静脉用药，可以口服硫酸镁、大黄等导泻的药物；治疗慢性胰腺炎可以口服消化酶治疗。
急性胰腺炎患者一般口服药物治疗较少，这类患者需要及时禁食、禁水，大量静脉补液治疗。同时需要用抑制胃酸分泌的药物，比如奥美拉唑、泮托拉唑等。重症患者还需要用一些抑制胰酶分泌的药物，对于并发麻痹性肠梗阻的患者需要口服硫酸镁及大黄导泻。当患者胰腺功能逐渐好转，胃肠道功能逐渐恢复后，可以用一些促进胃肠道蠕动的药物来帮助胃肠功能恢复，常用的药物包括莫沙必利、伊托必利等。
慢性胰腺炎患者外分泌功能不足，可以口服一些复方消化酶制剂，比如复方阿嗪米特。同时还可以用一些肠道益生菌制剂来调节肠道菌群，比如乳酸菌素片、双歧杆菌四联活菌片等。