只要是手术治疗都可能出现后遗症，所以肾上腺囊肿手术治疗后，也可能留下后遗症。目前肾上腺囊肿的手术治疗方式，以腹腔镜下肾囊肿切除术为主，该手术的后遗症包括以下几点：
1.术后出血，肾上腺的血运非常丰富，通常表现为创面的广泛渗血，不宜止血，所以存在术后出血的可能。
2.损伤周围脏器、组织、血管及神经，肾上腺周围有肾脏、胸膜、膈肌、肾上腺中央静脉等，损伤后可能出现相关疾病。
3.腹腔内手术可能造成肠粘连，腹膜后途径可能引发腹膜后感染。