附睾囊肿主要是存在于附睾的良性占位性病变，囊肿内液体主要是精液，此类手术在泌尿外科进行，后遗症主要有术后出血、水肿以及远期的睾丸、附睾萎缩，因为囊肿手术之后会影响到附睾周围的血管，那么如果血管出现损伤可能会导致睾丸萎缩。
如果只是单纯性，将囊肿剥除，一般并没有什么后遗症，也不用过度担心，但是囊肿如果较小，没有任何症状，不需要进行手术治疗，只需要对症随访、观察即可，只有在囊肿较大压迫周围导致出现症状才需要进行囊肿切除手术。