小孩在医生的指导下吃适量的头孢，不会出现明显的副作用。部分儿童可能会出现轻微的腹痛、腹泻或呕吐等症状。这些症状在停用药物1~2天后，会自行缓解。
过敏性体质的儿童在服用头孢后，也可能会出现荨麻疹。所以小孩在吃头孢前最好进行皮试，以免出现过敏反应，甚至危害小孩的身体健康。
长期或大量使用头孢时，还可能会损伤到孩子的肾脏，特别是年纪较小，或肾脏功能未发育完全的儿童。小孩在服用头孢时一定要遵从医嘱，不能擅自加药或停药，以免影响整体的疗效。