因采取肺部活检的方法不同，其所需要的时间长短不一。临床上常通过支气管镜的检查和相应的活检以取得肺病理组织，例如在支气管镜下发现支气管内部可疑新生物或异常的黏膜病灶的活检，可通过活检钳或冷冻活检的方法，其操作时间一般在20到30分钟左右。
另外，还可以通过彩超或CT引导下的经皮肺穿刺活检，通过此些影像学检查精确地定位，直接对肺外周组织的病理活检，此项操作一般半个小时左右。
部分患者还需要通过胸腔镜或开胸肺部活检，通过此种手术活检能取得更大的肺组织和病理组织，其准确度更加精确，但其操作时间通常是要根据手术情况来定。