新生儿低血糖综合征的症状表现得并不是特别典型，大多数低血糖者可以没有临床症状，当监测全血血糖值时会小于2.2mmol/L。
少数有低血糖症状患儿可出现喂养困难、嗜睡、精神差、青紫、哭声异常、颤抖、震颤，甚至可以出现惊厥等非特异性症状，一般经过静脉注射葡萄糖后症状消失，血糖可以恢复到正常值。
若是低血糖未及时纠正，可以出现严重的并发症。由于低血糖可以引起脑部组织含糖减少，进一步发展可导致脑部损伤，也会导致心肺功能衰竭。因此，对于高危儿应在出生后反复的监测血糖，排除是否存在有低血糖的症状。