注射胰岛素有副作用，其常见的副作用包括低血糖、过敏反应、注射部位脂肪代谢障碍、水肿、屈光不正、体重增加等。其中低血糖主要与胰岛素剂量相关，如果胰岛素使用剂量过量就可能发生低血糖。
胰岛素注射期间需监测血糖，根据血糖调整用量，减少低血糖发作。过敏反应包括局部性或全身性皮疹、瘙痒等，一般停用胰岛素或者使用抗过敏药物可缓解。
脂肪代谢障碍，通过在注射区域内轮换注射点可减轻。水肿、屈光不正，一般出现在胰岛素治疗的初始阶段，通常为一过性的。