甲亢的患者甲状腺毒症控制不良，有可能会导致死胎。除此以外，甲状腺毒症控制不良可能与流产、妊娠高血压，还有低出生体重儿、胎儿生长受限、死产、甲状腺危象以及孕妇充血性心力衰竭等，都有关系。
所以对于甲亢的患者，一般建议在甲状腺毒症控制稳定，停药以后，或者是使用比较小的抗甲状腺药物剂量时，再怀孕比较理想。如果在治疗期间意外受孕，要注意到专科医院及时的就诊，调整药物。
一般建议在孕早期使用并流氧嘧啶治疗。孕中期和孕晚期，建议选择甲巯咪唑进行甲亢的治疗。