结肠炎通常可以由致病微生物入侵肠道粘膜、自身免疫因素、精神因素、过敏因素以及放射性物质的损伤等原因引起。
根据致病原因的不同，结肠炎可以分为感染性结肠炎、炎症性结肠炎以及特殊类型的结肠炎。
感染性的结肠炎是由于肠道粘膜受到病毒、细菌等微生物的入侵，引起炎症反应，导致腹痛、腹胀、腹泻等临床症状。
自身免疫及精神因素，可以引起溃疡性的结直肠炎以及肠道克罗恩病等炎症性肠炎。
特殊类型的结肠炎包括过敏性结肠炎以及放射性结肠炎等类型。