幽门螺杆菌的检测方法分为两类：
一、有创伤性的；
二、没有创伤性的。有创造性的检查需要通过电子胃镜检查，取胃的黏膜活组织进行检测，主要包括快速尿素酶试验、组织学检查、幽门螺杆菌的培养。没有创造性的检查，包括碳13呼气试验、碳14呼气试验、粪便幽门螺杆菌抗原检测、血清学检查。
最常使用的是碳13或碳14尿素呼气试验，要求的是空腹、餐后两小时以后口服一粒含有碳13或碳14尿素胶囊，等待20分钟左右就可以进行呼气试验，大约几分钟后，可以检测出是否有幽门螺杆菌的感染。碳13或碳14呼气试验敏感性和特异性比较高，没有痛苦，所以患者依从性比较好，也是作为根除幽门螺杆菌治疗后复查的首选方法。