孕晚期胎停，有一部分是和胎儿自身的发育情况相关，比如有的胎儿本身就存在有心脏或者其他的脏器发育异常，发生胎停的几率就会比较大。有的胎儿发生胚胎停育，是孕妇在怀孕早期或者孕前，存在血糖高影响。
有的胚胎停止发育和胎盘功能有关，胎盘功能严重下降，也会导致慢性缺氧的胎儿停止发育。有的胚胎停育是脐带因素导致，比如脐带发生严重的扭转或者是死结等，都可能会影响到脐带循环。
有少数的胚胎停育是和孕妇严重的营养不良，有严重的血栓前状态、子宫循环不好等相关。