尿液分叉是否可以自愈，与引起尿液分叉的疾病有关。如果仅就是每次排尿量很少，这种情况通过多喝水，每次排尿大于200ml，有可能自己恢复。
如果是因为尿道炎、尿道内分泌物多引起，这种情况需要通过药物治疗，因为尿道有炎症尿道黏膜会有水肿，尿道内会有炎性分泌物就会影响尿流的流动，就表现可能出现尿液分叉。需要在急性期进行治疗，最常见的就是吃广谱抗生素，吃药3~5天就可以达到临床治愈。
如果是因为尿道狭窄引起的尿液分叉，这种情况需要通过尿道扩张或者是手术治疗，才可以达到临床治愈。出现尿液分叉后，需要就诊泌尿外科，找清楚是什么疾病引起。