病理性卵巢囊肿是不可能自愈的，而生理性卵巢囊肿可以自愈。所以，一旦发现卵巢囊肿，一定要区别开是生理囊肿还是病理性囊肿。
生理性囊肿绝大部分会在月经之后囊肿明显缩小或者是消失，所以，不用给予相应的治疗，就能达到自行痊愈的目的。而病理性囊肿常常在临床上需要考虑手术给予治疗，比如当囊肿直径大于5cm，或者出现囊肿周围感染，或者是出现囊肿蒂扭转的情况，都可以考虑给予手术进行治疗。并且在术后要定期地给予随访，来了解囊肿局部是否有复发的现象。
另外，就是建议女性要定期地做妇科检查，发现异常及时处理。