早上起来肚子疼考虑是以下原因：
1.晚上睡觉的时候没有注意腹部的保暖。冬天或者待在空调房内时，容易导致寒气侵入，引起胃肠道平滑肌发生收缩、痉挛，导致肚子疼痛。可以适当用热水袋热敷、轻轻按摩，一般很快能够缓解。
2.胃部方面的疾病，比如胃溃疡、十二指肠溃疡。因为早上起来的时候，空腹的情况下胃酸分泌较多，对溃疡面造成刺激，进而引起肚子发生疼痛，通常伴有恶心、反酸等不适感。
3.消化不良。通常是晚餐进食过多难消化的食物，经过一夜的消化食物还没有排空。囤积的食物对胃壁造成刺激，胃部胀痛引起肚子疼痛。