植物神经功能紊乱与患者存在社会心理应激因素有关，部分患者可存在遗传因素、性别因素、生物因素。
植物神经功能紊乱病因治疗主要是心理疏导及选用谷维生素等调节神经，并可使用安定类改善睡眠及抗抑郁药调节情绪，植物神经紊乱治疗更多的是对症治疗。
如表现为心慌、胸闷，出现房性早搏、室性早搏或窦性心动过速，则可选用倍他乐克或普萘洛尔。如腹胀、纳差可选用曲美布汀或消化酶改善症状。出现尿频、尿急，则选用坦罗新解除尿道痉挛改善症状，表现为腹痛、腹泻，则可选用蒙脱石散或双岐杆菌改善症状，以上均为植物神经紊乱治疗方法。