临床上腘窝囊肿主要是膝关节后方腘窝处的滑囊，或者关节内滑膜囊异常膨大后突造成的。
分为先天性和后天性两种，临床上以后天性常见。后天性腘窝囊肿发病患者多为老年人，女性发病率高，大多与膝关节组织退行性病变相关。主要通过临床查体和影像学及B超检查来确诊。查体时俯卧位，左右两侧腘窝对比着进行检查，患侧可触及腘窝半球样包块，质地中等硬度，与关节相通时，活动关节后，可略微变小，边界比较清楚，活动度不大，无明显压痛。辅助检查主要依靠超声进行确诊。
治疗上，小的囊肿可以观察，较大、伴有疼痛或是明显影响膝关节活动的囊肿，可以手术切除。