急性角膜炎的治疗原则是积极控制感染，减轻炎症反应，促进溃疡愈合，减少角膜瘢痕形成。如果是急性细菌性角膜炎，早期应选择广谱抗菌滴眼治疗，再根据细菌培养和药敏实验结果调整为敏感抗生素，眼局部频繁滴抗生素眼药水，如左氧氟沙星滴眼液、妥布霉素滴眼液等。
角膜炎可能向眼内或全身播撒者需要全身途径给药，合并睫状体炎时，给予睫状肌麻痹剂，局部再滴用胶原酶抑制剂，口服维生素等促进溃疡愈合。药物治疗无效，病情急剧发展的患者，可以手术治疗，包括病灶清除联合结膜瓣遮盖术、板层角膜移植或穿透性角膜移植术。病毒性角膜炎，则用抗病毒药物抑制病毒复制，减轻炎症反应。