虽然两者都会有黄疸、肝脾肿大的表现。新生儿败血症是炎症感染性疾病，新生儿溶血症是因为母子血型不合引起来的免疫反应性溶血，两者发病的病因不同，治疗方法不一样。
新生儿败血症可以分为早发性和晚发性，早发性多在出生后7天之内发病，有羊水早破或者母亲感染的一些病史可循，选用敏感抗生素治疗。新生儿溶血可以分为ABO溶血和RH溶血，一般在出生后24~48小时发病，黄疸呈进行性加重。
查血液中胆红素浓度增高，血补体释放试验阳性，能够确诊。主要的原因是血液中的胆红素浓度增高引起的，可以用换血疗法或者蓝光照射退黄。