子宫内膜异位症会增加患卵巢囊肿的风险，主要是增加患卵巢巧克力囊肿的风险。因为卵巢巧克力囊肿就是因为子宫内膜异位症引起，是因为子宫内膜异位到卵巢内，有活力的子宫内膜在卵巢内周期性的生长，周期性的出血，经血长期积聚于囊腔内而形成。
子宫内膜异位症可以异位到身体的任何一个部位，所以不仅会增加患卵巢囊肿的风险，还会引起其它的不适，比如会引起月经异常、月经量增多、痛经，还会引起不孕不育，有些会引起大小便异常。
子宫内膜异位症对女性的身体危害很大，要预防子宫内膜异位症，要降低卵巢囊肿的风险，平时一定要注意经期卫生，经期不要同房，也不要剧烈运动，还要减少一些子宫腔内的手术操作。