更年期头疼，最为常见的原因可能是植物神经功能紊乱，由于更年期的人机体内的激素分泌紊乱，雌激素水平明显下降，容易对植物神经功能产生影响，进而引起明显的头痛症状，还可伴有失眠多梦、气短、胸闷、爱发脾气等表现。
也可能是由于血压波动升高所引起，由于更年期的人情绪不稳、睡眠质量差，很容易导致血压不稳，出现波动升高的情况，就会引起头疼。
另外，还可能为脑血管疾病所致，常见于脑出血、脑梗塞、脑动脉供血不足等，都可导致病人出现明显的头痛症状。因此，更年期头痛，应及时明确诱因，对症处理，避免盲目滥用药物。