尿道炎是由于病原微生物感染所引起。针对不同病原体引起的尿道炎使用的药物也不同，主要是针对病原体选取敏感的抗生素经进行治疗。
对于淋菌性尿道炎通常采用头孢类药物进行治疗。对于非淋菌性尿道炎多是由于衣原体、支原体感染所引起，一般使用左氧氟沙星和克拉霉素等，对于由于支原体、衣原体所导致的尿道炎有很好的效果。
而霉菌性尿道炎则需要使用抗霉菌的药物进行治疗。另外，对于滴虫性尿道炎，需要针对性的使用甲硝唑、替硝唑进行抗炎处理，以上药物可以通过口服方式也可以静滴给药。一定要在医生的指导下用药不要擅自用药，症状严重者建议及时到医院就诊。