肉瘿又可以称为甲状腺结节，由于引起该病的病因较多，所选用的药物也应当与病因相对应。
对于气虚痰阻的患者，需要进行理气疏郁、化痰消瘿，可以使用四海舒郁丸为主要处方，并酌情使用海藻、昆布、煅瓦楞等消瘿散结的药物进行加减。
另外，心肝阴虚的患者也比较容易引起肉瘿的出现，治疗往往需要滋阴降火、宁心柔肝，可以选用天王补心丹或者一贯煎进行加减，以滋阴降火为主，并辅助一些行气消瘿的药物。另外，像中成药消瘰丸、小金片等药物都是针对病因的专科药物，也可以酌情选用。