人类的肠道是一个复杂的微生态环境，包括细菌、真菌、病毒、病原虫等多种微生物，并且以细菌为主。正常肠道内的这些微生物称之为肠道菌群。某些肠道疾病等会影响其动态平衡，导致平衡失调，引起的临床症状称之为肠道菌群失调。
主要表现为腹泻，也可伴随腹胀、腹痛和一系列的腹部不适感。长时间腹泻又能加重肠道的菌群失调，二者互为因果，相互影响。
因此调整饮食习惯、合理用药，投入微生态制剂，如益生菌等，可以合理地改善菌群失调。