如果发生肺部的真菌感染是一种比较严重的疾病，本病是很难完全治愈。
绝大部分是用于不当的应用抗生素所引起，肺部真菌感染是否严重主要和感染的程度、自身的抵抗力等因素有关。本病发病时应进行抗真菌治疗，常选的药物主要为两性霉素B、氟康唑等，有时需要做细菌培养。一般真菌感染需要治疗的时间较长，有的患者可能会达到将近三个月甚至更久。
建议在发生感染性疾病的时候应进行规范化的治疗，避免出现继发性的真菌感染，严重危害人体的身体健康，而且也需要加强护理。