喝咖啡后小便有咖啡味，可能为正常的生理性因素所引起，也可能与病理性的因素有关。
一般在饮用咖啡后，小便存在咖啡味为正常的生理现象，主要是由于咖啡当中含有较多的咖啡因成分。咖啡因在进入人体后通过机体的新陈代谢，部分完全消化、吸收，而部分咖啡因会以原形经由尿液排出，致使小便有咖啡味。而且咖啡当中除了含有咖啡因以外，还含有一些芳香味的成分，这类物质难以完全吸收，也会造成小便有咖啡味。
另外，如果本身患有肾功能不全、肾小球肾炎等疾病，导致肾功能减退或丧失，致使咖啡以原尿的形式析出，也会造成小便有咖啡味，这种情况属于病理因素。