排卵障碍和卵巢早衰是有区别的。排卵障碍和卵巢早衰虽然都是卵巢功能的异常，但是排卵障碍的卵巢不一定有衰退的情况。
它主要是由于下丘脑-垂体-卵巢性轴功能异常，导致卵巢不排卵，出现了月经不规则、月经稀发、月经量减少、月经淋漓不尽、不孕不育等症状，常见的疾病有多囊卵巢综合征、高催乳素血症、甲状腺功能异常等。
在经过系统性的激素类药物调理后，排卵障碍的症状能够得到明显的缓解。但是卵巢早衰主要是针对40岁以前的女性，因为某些原因导致了卵巢功能提前衰退，进一步出现了低雌激素、高促性腺激素的症状，例如继发性闭经，并且还有围绝经期的症状出现。在通过一系列的药物治疗后，卵巢功能不一定能够得到完全的恢复。因此，这两者是有区别的。