咽部脊索瘤的常见症状表现，较长的病程可有头疼以及进行性鼻塞，嗅觉减退、出现脓性鼻涕、闭塞性鼻音，常有打鼾、耳鸣和耳胀闷堵感，听力也会有不同下降表现。
累及脑神经、脑干和垂体时可导致眼球运动障碍、视力下降、视野受损，步态改变。也可造成第二性征退化，出现不孕不育，体格检查时可有病理反射出现。本病治疗主要以手术为主，手术入路选择以尽可能全切肿瘤为目的。
对于生长部位复杂的咽部可选择联合入路，肿瘤完全切除后，通常预后良好。