眼睛囊肿的类型有很多，各有不同的形成因素和过程。
最常见的眼睛囊肿是麦粒肿，麦粒肿是比较急性的化脓性炎症感染疾病，其形成主要与眼睑受到细菌感染、机体免疫力下降、不注意用眼卫生和习惯等因素相关，致病菌可通过腺体开口进入眼睑内侧，逐渐形成感染病灶，随着腺体分泌物的堆积产生隆起的炎性囊肿。
结膜囊肿的形成除了眼表炎症刺激之外，还受到先天性发育不良、外界环境刺激、手术、外伤等因素影响，逐渐产生增生性囊肿，以中空结构为主。