黄体酮属于孕激素，属于天然的孕激素种类之一。一般情况正常量基本不会有大的副作用发生，但是如果吃多了或者由于个体差异，也有一些女性会出现明显的不良反应。比如有一些女性会有比较明显的胃肠道反应，会有明显的恶心、腹胀、胆囊炎，或者胰腺炎等发生，也有时会有头晕、头痛、嗜睡等症状。
有少数患者会引起明显情绪变化，甚至明显抑郁。少数患者还会有乳房胀痛、乳头溢液等症状出现。也有更小的几率可能发生乳腺癌、肺栓塞，或者其他的栓塞问题等。