肛周脓肿形成的原因包括一下几个：
第一，肠道菌群失调，当肠道菌群失调或者机体抵抗力低下时，肠道内的细菌即可进入人体的各个组织器官，从而发生内源性的感染，如果侵入到肛门直肠周围，就会导致肛周脓肿的产生。
第二，肛窦炎或者肛腺炎。当肛窦局部出现水肿、炎症时，就会堵塞肛腺而会阻止肛腺的正常分泌，会引起肛腺炎的发生，而肛腺的炎症向肛门直肠周围破溃以后就会导致肛周脓肿的产生。
第三，其他的因素，包括医源性因素，比如肛门镜检查、直肠指诊，还有肛门直肠的损伤等等都有可能会导致肛周脓肿的产生。