两者有本质的区别，脐尿管囊肿是良性疾病，癌症是恶性疾病。脐尿管随着生长发育，孩子生下来以后，脐尿管会闭锁、会萎缩。
但是，由于种种原因，如果脐尿管没有萎缩、闭锁话，那么有可能会形成囊肿。这时，病人表现为脐周可能会有包块或者如果感染后有疼痛、红肿，甚至会有流脓的现象。而癌症往往在脐周可能会有实质性的包块。做B超和CT可以鉴别出来，脐尿管囊肿是液性，而癌症往往是实质性的东西。如果两者做手术的话，那么取下来的标本，做病理分析也可以鉴别出来。