肛周脓肿根治手术也就是一次性把肛周脓肿彻底根治。
主要是通过在传统的手术上再增加一种根治手术，也就是在肛周脓肿的表面做一个切口，手术中的切口大小，要超过肛周脓肿的直径。然后再进行脓液引流，脓液排干净后，可以通过探针进行仔细查找引起脓肿的内口，进行彻底切除，达到根治的效果。但是术后还需要静脉点滴喹诺酮类、头孢类的抗生素抗感染治疗，控制炎症，促进炎症的吸收。
肛周脓肿根治手术，可以避免肛瘘的形成，一般不会造成二次复发，可以减轻患者的痛苦，也可节省手术费用。