乙状结肠镜并非是直肠镜，虽然都属于内镜检查，但两者有以下一些区别：
首先，两者检查的范围不同。乙状结肠镜可以检查肛管、直肠以及部分乙状结肠的疾病。而肛门镜只能检查肛管以及下端直肠的疾病，乙状结肠镜相对检查范围更广。
其次，肠道准备方式不同。肛门镜并不需要肠道准备，但一般建议患者在排便后检查。而乙状结肠镜需要进行肠道准备，需要进行清洁灌肠或者口服泻药，将肠道内的粪便排泄干净。
另外，可以通过乙状结肠镜进行一些治疗，例如取活检或者息肉摘除等。而肛门镜并没有治疗的功能。