乙状结肠镜是诊断直肠疾病的重要手段，主要用于观察直肠，甚至能观察部分乙状结肠，所以凡是怀疑有直肠病变的患者，都应该进行乙状结肠镜检查。
乙状结肠镜检查，可以证实直肠指诊发现的疾病，还可以了解肛门直肠指诊无法判断的疾病，对怀疑有直肠炎症、溃疡、息肉等疾病，需进一步明确诊断或做鉴别诊断时，有必要做乙状结肠镜检查。
据统计，直肠癌占大肠癌的40%~60%，乙状结肠镜可直接观察到直肠癌，是直肠癌早期筛查的首选检查。