脚趾甲变厚发黄可能是发生了甲癣，趾甲可以发生真菌感染，趾甲感染真菌后增厚，失去光泽，颜色可以变灰、变暗，大脚趾发生甲癣的风险最高。
有些患者还要考虑可能是发生了厚甲症，可能和代谢性的因素有关，有些患者可能存在营养不良，趾甲变厚后脆性会增加，颜色会发黄。有些患者发生脚趾甲变厚发黄还可以见于银屑病的患者。
临床上有时很难区分脚趾甲变厚发黄的具体病因，可以对趾甲进行病理的检查，明确趾甲病变的具体病因。