脚趾甲变厚最常见的原因是出现了灰指甲，灰指甲属于真菌感染的皮肤疾病。真菌侵犯甲板、甲床时导致指甲部位的角质层堆积，指甲会变厚、变黄、浑浊、变脆等，属于传染性的皮肤疾病。如果治疗不及时，会传染给其他脚趾甲，还会让脚趾甲变得越来越厚，严重还会出现甲板脱落的情况。
出现脚趾甲变厚，还有一种情况考虑是钾营养不良，跟维生素、微量元素等缺乏有一定关系。如果出现一些疾病情况下，如有甲状腺疾病、血液循环系统受到影响，肢体末端供血不足，脚趾甲生长速度变缓，也会出现脚趾甲变厚。