大部分肠梗阻患者的主要症状就是腹痛和大便不能排出，因此手术前是不能够清理大便的，但是手术中可以根据具体情况来清理胃肠道内容物，包括大便。
对于慢性肠梗阻患者可以在手术前一个月就改变饮食，以流食和半流食为主，这样在手术前就可以适当地应用一些排便药物，来清除胃肠道内的粪便。
但是对于急性肠梗阻患者，一般需要进行急症手术才能治疗，部分患者在解除肠梗阻的过程中，需要切除部分坏死或失活的肠管，并清理肠道内容物，如大便等。