卵巢巧克力囊肿如何防止复发，主要依据卵巢巧克力囊肿的治疗方式而定。
一般卵巢巧克力囊肿是给予手术治疗的，手术方式有保留卵巢功能的手术以及根治性的手术。如果是根治性的手术，也就是将卵巢以及囊肿完全切除，在这种情况下术后是不容易复发的。但仅限于年纪大、没有生育要求、症状特别严重的女性。如果是保留卵巢功能的手术，仅仅是将巧克力的囊肿给予剥除，需要在术后给予药物系统性的治疗，以防止复发。而药物的选择常见的有以下几种：
1.口服避孕药。主要是通过假孕疗法的原理萎缩内膜，减少经量。
2.孕三烯酮。这种药物的原理是假绝经疗法，副作用比较小、用药量少，而且也方便。
3.促性腺激素释放激素激动剂。这是比较常用的一种药物，主要的原理是似药物性卵巢切除的疗法。
不管是哪种药，在使用过程中都有可能出现经量减少，甚至闭经。但不要担心，停药后会慢慢恢复。